SD Muhammadiyah 2 Pontianak terletak di persimpangan jalan Jenderal Ahmad Yani dan Jalan Ahmad Sood, yang berada dalam Komplek Lembaga Pendidikan Muhammadiyah di  bawah penyelenggaraan Majlis Pendidikan Dasar dan Menengah Pimpinan Wilayah Muhammadiyah Kalimantan Barat.

SD Muhammadiyah berdiri tanggal 1 Januari 1975 sesuai dengan SK Pengesahan dari MAPENDAPU No. 926-1006/KB-75/1978 tanggal 20 Maret 1978 dan mendapat izin operasional dari Kakanwil P dan K  atas nama Menteri Pendidikan dan Kebudayaan No. 102/114/Kep/E/1989.

Kemudian sejak tanggal 21 Maret 1989 menjadi Sekolah Percontohan Muhammadiyah Kalimantan Barat berdasarkan SK No. A-1/62/III/1989 yang dikeluarkan Pimpinan Wilayah Mahammadiyah Kalimantan Barat  tentang Sekolah Percontohan yaitu SD Muhammadiyah 2 Pontianak, SMP Muhammadiyah 1 Pontianak, SMA Muhammadiyah 1 Pontianak dan SMK Muhammadiyah 1 Pontianak di bawah  penyelenggaraan Majlis Dikdasmen PWM Kalimantan Barat.

Adapun Nomor Statistik Sekolah ( NSS )  : 102136003038 , dan Nomor Daftar Sekolah ( NDS ) : M07031005, Nomor Induk Sekolah ( NIS ) : 100383, Nomor Pokok Sekolah Nasional ( NPSN ) : 30105255.

Status Akreditasi SD Muhammadiyah 2 Pontianak mendapat Nilai “ A “ sesuai dengan Keputusan Badan Akreditasi Nasional Sekolah/Madrasah ( BAN-S/M ) Provinsi Kalimantan Barat Nomor Seri: Dd. 047788 tanggal 25 Oktober 2011.

Kepala sekolah yang menjabat di SD Muhammadiyah 2 Pontianak sebagai berikut :

1. BAHRUN SUTAN MELANO ( Alm. .Periode Tahun 1975 – 1979)

2. WASHLIE SJAFIE ( Periode Tahun 1979 – 1997 )

3. H. SLAMET RIANTO (Periode Tahun 1997  s.d.  2004)

4. Drs. HATTA ABDULHAJI HM. (Periode Tahun 2004   s.d.  2008)

       5. H. SLAMET RIANTO (Periode Tahun 2008  s.d.  2012)(Periode Tahun 2012 s.d. 2016)